Thông tư 90/2026 thay đổi toàn bộ quy trình đăng ký thuế từ tháng 7: Doanh nghiệp phải chuẩn bị gì?

Bộ Tài chính vừa ban hành Thông tư 90/2026/TT-BTC ngày 30/6/2026, hướng dẫn chi tiết các quy định mới về quản lý thuế sẽ có hiệu lực từ 1/7/2026. Đây là một bộ luật lớn nhằm cập nhật toàn bộ hệ thống đăng ký, cấp mã số thuế và quản lý thông tin thuế cho các đối tượng từ doanh nghiệp, hợp tác xã, hộ kinh doanh đến các nhà cung cấp nước ngoài. Thông tư này bổ sung chi tiết cho Luật Quản lý thuế 2025 và Nghị định 252/2026/NĐ-CP.

Quy định về đăng ký thuế và cấp mã số thuế

Thay đổi lớn nhất liên quan đến thủ tục đăng ký thuế và cấp mã số thuế. Mã số thuế được coi là một định danh duy nhất cho mỗi đối tượng nộp thuế, giúp cơ quan thuế quản lý hiệu quả hơn. Theo Thông tư 90/2026, quy trình đăng ký được tối ưu hóa với các bước rõ ràng, giảm thời gian xử lý và yêu cầu tài liệu. Điều này áp dụng cho doanh nghiệp, hợp tác xã, hộ kinh doanh, cá nhân kinh doanh tự do, cũng như nhà cung cấp nước ngoài và nhà thầu nước ngoài có hoạt động tại Việt Nam. Các tổ chức có trách nhiệm khấu trừ, nộp thay thuế cũng phải tuân thủ quy định này.

Quản lý thay đổi thông tin và tạm ngừng mã số thuế

Thông tư cũng quy định chi tiết về thủ tục thay đổi thông tin đã đăng ký. Khi doanh nghiệp thay đổi địa chỉ, người đại diện, loại hình kinh doanh hoặc bất kỳ thông tin nào liên quan đến việc nộp thuế, phải khai báo với cơ quan thuế trong thời gian quy định. Ngoài ra, Thông tư cũng hướng dẫn rõ ràng về tạm ngừng mã số thuế trong trường hợp doanh nghiệp tạm dừng hoạt động nhưng chưa giải thể hoàn toàn. Điều này giúp cơ quan thuế không cấp thông báo nợ hoặc xử phạt trong thời gian tạm ngừng, đồng thời bảo vệ quyền lợi của doanh nghiệp.

Chấm dứt và khôi phục mã số thuế

Khi doanh nghiệp chính thức giải thể hoặc chấm dứt hoạt động, mã số thuế sẽ bị chấm dứt. Thông tư 90/2026 quy định rõ ràng điều kiện, thủ tục và tài liệu cần thiết để chấm dứt mã số thuế. Đặc biệt, Thông tư cũng quy định khả năng khôi phục hiệu lực mã số thuế cho những doanh nghiệp tạm ngừng và sau đó tiếp tục hoạt động. Điều này cung cấp sự linh hoạt cho các doanh nghiệp trong quá trình điều chỉnh kinh doanh.

Ví dụ thực tế

Một công ty TNHH đã đăng ký kinh doanh từ năm 2020 với mã số thuế cũ theo Thông tư 86/2024/TT-BTC. Từ ngày 1/7/2026, công ty này cần cập nhật thông tin theo quy định mới, bao gồm việc xác nhận lại dữ liệu, thay đổi nơi đăng ký nếu có chuyển địa điểm. Nếu công ty tạm dừng hoạt động 3 tháng để cải tổ, thay vì chấm dứt mã số thuế, có thể tạm ngừng và sau đó khôi phục khi hoạt động trở lại.

Lưu ý quan trọng

Doanh nghiệp, hộ kinh doanh và các đối tượng nộp thuế phải chuẩn bị sẵn sàng từ nay để tuân thủ quy định mới từ 1/7/2026. Kiểm tra lại thông tin đăng ký, chuẩn bị tài liệu cần thiết và tham khảo chi tiết tại Thông tư 90/2026 hoặc liên hệ cơ quan thuế địa phương.